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Carlos Alejandro Trujillo Anaya

Associate Professor at the department of Physical Sciences, School of Sciences, EAFIT University.

Foto de Carlos Alejandro Trujillo Anaya

    Resumen/Summary

    Resumen/Summary

    Carlos Alejandro Trujillo Anaya Ingeniero Físico, Magíster en Ingeniería y Doctor en Física por la Universidad Nacional de Colombia - Sede Medellín. Es profesor asociado en el departamento de Ciencias Físicas de la Escuela de Ciencias de la Universidad EAFIT y forma parte del grupo de investigación en Óptica Aplicada de la misma institución.

    Cuenta con 9 años de experiencia en la enseñanza universitaria en cursos de electrónica digital, microcontroladores, aprendizaje automático, visión por computadora y óptica. Sus principales intereses de investigación incluyen, pero no se limitan a, holografía digital, técnicas de recuperación cuantitativa de fase, procesamiento de imágenes y aprendizaje automático.

    El profesor Trujillo ha sido autor y coautor de 25 artículos publicados en revistas científicas con arbitraje internacional, además de haber presentado en conferencias a nivel nacional e internacional. También ha sido galardonado con una patente de invención y dos registros de software. Ha ejercido como evaluador por pares en revistas de alto impacto en el campo de la óptica aplicada, como Optics and Lasers in Engineering, Optics Letters, Applied Optics y Optics Express.

    Intereses académicos e investigativos/Research and Teaching Interest

    Intereses académicos e investigativos/Research and Teaching Interest

    1. ​The principal research interests include, but are not limited to, digital holography, quantitative phase imaging, image processing, and machine learning.
    2. Las áreas de interés investigativo incluyen, pero no se limitan a, holografía digital, técnicas de recuperación cuantitativas de fase, procesamiento de imágenes y aprendizaje de máquina.​
    Estudios realizados/Education

    Estudios realizados/Education

    1. B.S. Engineering Physics, M.S Engineering and Ph.D. in Physics from the National University of Colombia - Medellín campus.
    2. Ingeniero Físico, Magíster en Ingeniería y Ph.D. en Física de la Universidad Nacional de Colombia - Sede Medellín.​​​

    Publicaciones/Publications

    Publicaciones
    Artículos en revistas arbitradas

    1. C. Trujillo, P. Piedrahita-Quintero, J. García-Sucerquia, “Digital lensless holographic microscopy: numerical simulation and reconstruction with ImageJ”, Applied Optics, 59 (19), 5788-5795, 2020.
    2. C. Trujillo, J. García-Sucerquia, “Automatic detection and counting of phase objects in raw holograms of digital holographic microscopy via deep learning”, Optics and Lasers in Engineering, 120, 13-20, 2019.
    3. C. Trujillo, J. García-Sucerquia, “Numerical dark field illumination applied to experimental digital lensless holographic microscopy for reconstructions with enhanced contrast”, Optics Letters, 43 (17), 4096-4099, 2018.
    4. C. Trujillo, J. García-Sucerquia, “Phase-shifting digital holographic microscopy by using a multi-camera setup”, Optics Letters, 42 (23), 4841-4844, 2017.
    5. C. Trujillo, J. García-Sucerquia, “Cooperative execution of auto-focusing metrics in digital lensless holographic microscopy for internal-structured samples”, Applied Optics, 56 (21), 5877-5882, 2017.
    6. P. Piedrahita-Quintero, C. Trujillo, J. García-Sucerquia, “JDiffraction: A GPGPU-accelerated JAVA library for numerical propagation of scalar wave fields”, Computer Physics Communications, 214, 128-139, 2017.
    7. C. Trujillo, R. Castañeda, P. Piedrahita-Quintero, J. García-Sucerquia, “Automatic full compensation of quantitative phase imaging in off-axis digital holographic microscopy”, Applied Optics, 55 (36), 10299-10306, 2016.
    8. C. Trujillo, A. Doblas, G. Saavedra, M. Martínez-Corral, J. García-Sucerquia, “Phase-shifting by means of an electronically tunable lens: quantitative phase imaging of biological specimens with digital holographic microscopy”, Optics Letters, 41 (7), 1416-1419, 2016.
    9. C. Trujillo, J. García-Sucerquia, “Comparative analysis of the modified enclosed energy metric for self-focusing holograms from digital lensless holographic microscopy”, Applied Optics, 54 (16), 5102-5108, 2015.
      C. A. Trujillo, J. García-Sucerquia, “Automatic method for focusing biological specimens in digital lensless holographic microscopy”, Optics Letters, 39 (9), 2569-2572, 2014.
    10. C. Trujillo, J. García-Sucerquia, “Accelerated numerical processing of electronically recorded holograms with reduced speckle noise”, IEEE Transactions on Image Processing, 22 (9), 3528-3537, 2013.
    11. C. Trujillo, J. F. Restrepo, J. García-Sucerquia, “Video rate reconstruction of holograms from digital in-line holographic microscopy”, Dyna, 79 (173), 25-31, 2012.
    12. C. Trujillo, J. García-Sucerquia, “Graphics processing units: more than the pathway to realistic video games”, Dyna, 78 (168), 164-172, 2011.
    13. C. Trujillo, J. I. García-Sucerquia, “Localización de fuentes sonoras por multilateración”, Revista Colombiana de Física, 42 (3), 373, 2011.
    14. C. Trujillo, S. Serna, F. Monroy, J. García-Sucerquia, “Convolution algorithm for numerical reconstruction of digitally recorded holograms with extended field of view”, Photonics Letters of Poland, 2 (4), 171-173, 2010.
    15. C. Trujillo, J. F. Restrepo, J. García-Sucerquia, “Real time numerical reconstruction of digitally recorded holograms in digital in-line holographic microscopy by using a graphics processing unit”, Photonics Letters of Poland, 2 (4), 177-179, 2010.


    Publicaciones en conferencias arbitradas

    1. C. Trujillo, J. García-Sucerquia, “Numerical dark field illumination for digital lensless holographic microscopy of biological samples”, OSA Imaging and Applied Optics Congress, June 22 – 26, 2020.
    2. C. Trujillo, J. García-Sucerquia, “Deep learning for digital holographic microscopy: automatic detection of phase objects in raw holograms”, OSA Imaging and Applied Optics Congress, June 22 – 26, 2020.
    3. C. Trujillo, J. García-Sucerquia, “Two-stage autofocusing methodology for digital lensless holographic microscopy”, OSA Imaging and Applied Optics Congress, June 25 – 28, 2018.
    4. C. Trujillo, R. Castañeda, J. P. Piedrahita-Quintero, J. García-Sucerquia, “Full compensation of quantitative phase images of digital holographic microscopy using GPU”, OSA Imaging and Applied Optics Congress, June 25 – 28, 2018.
    5. C. Trujillo, J. García-Sucerquia, “Two-coupled Mach-Zehnder interferometers in a multi-camera setup for phase-shifting applied to digital holographic microscopy”, OSA Imaging and Applied Optics Congress, June 25 – 28, 2018.
    6. L. Lagny, C. Trujillo, J. García-Sucerquia, P. Picart, “Vibration retrieval from time sequences of digital on-line Fresnel holograms”, OSA Imaging and Applied Optics Congress, June 25 – 28, 2018.
    7. C. Trujillo, R. Castañeda, J. P. Piedrahita-Quintero, J. García-Sucerquia, “Algorithm for full compensation of quantitative phase images in off-axis digital holographic microscopy”, IONS 2017, August 15 – 18, 2017.
    8. A. Doblas, C. Trujillo, G. Saavedra, M. Martínez-Corral, J. García-Sucerquia, “Phase-shifting method applied to digital holographic microscopy using a programmable liquid lens”, Focus on Microscopy 2017, April 10 – 15, 2017.
    9. C. Trujillo, J. García-Sucerquia, “Robust and computationally efficient self-focusing metric for in-line digital holograms”, RIAO OPTILAS 2016, November 21 – 25, 2016.
    10. C. Trujillo, J. García-Sucerquia, “Comparative analysis of self-focusing techniques of holograms in digital lensless holographic microscopy”, XIV Encuentro Nacional de Óptica ENO, November 16 – 20, 2015.
    11. C. Trujillo, J. García-Sucerquia, “Análisis comparativo de técnicas de enfoque automático de hologramas en microscopía holográfica digital sin lentes”, Congreso Nacional de Física, September 29 – October 2, 2015.
    12. C. Trujillo, J. García-Sucerquia, “Analysis of performance of the modified enclosed energy metric for self-focusing holograms from digital lensless holographic microscopy”, Focus Latin America 2014, November 11 – 14, 2014.
    13. N. Munera-Ortiz, C. Trujillo, J. García-Sucerquia, “Digital holographic interferometry accelerated with GPU: application in mechanical micro-deformation measurement operating at video rate”, July 22 – 26, 2013.
    14. C. Góngora, C. Trujillo, J. García-Sucerquia, “Enlace de comunicación RF de bajo costo”, Congreso Nacional de Física 2011, October 10-13, 2011.
    15. E. Franco, C. Góngora, C. Trujillo, J. García-Sucerquia, “Monitoreo inalámbrico de estructuras”, Congreso Nacional de Física 2011, October 10-13, 2011.
    16. C. Trujillo, J. García-Sucerquia, “Real-time numerical reconstruction of digitally recorded holograms”, 22nd Congress of the International Commission for Optics: Light for the Development of the World, August 15 – 19, 2011.
    17. C. Trujillo, J. García-Sucerquia, “Real time numerical reconstruction of digitally recorded holograms”, RIAO OPTILAS 2010: 7th Ibero American Conference on Optics, September 20-24, 2010.
    18. C. Trujillo, J. García-Sucerquia, “Localización de fuentes sonoras por multilateración”, Congreso Nacional de Física, October 11-15, 2009.

    Premios y Honores

    1. Summa Cum Laude (Tesis de Doctorado), 2018.
    2. Beca de inscripción, OSA Imaging and Applied Optics Congress, 2017.
    3. Beca para jóvenes investigadores, Universitat de València, 2015.
    4. Primer lugar en presentación de póster en ENOCANCOA, 2015.
    5. Beca de estudios de doctorado de Colciencias - Universidad Nacional de Colombia, grant no. 6172, 2014.
    6. Magna Cum Laude (Tesis de Maestría), 2013.
    7. Segundo lugar en presentación estudiantil en RIAO/OPTILAS 2013, Society of Photo-Optical Instrumentation Engineering, 2013.
    8. Beca de estudios de posgrado, Facultad de Minas, Universidad Nacional de Colombia, 2012.
    9. Mejores calificaciones en "Ingeniería Física", Universidad Nacional de Colombia, 2010.
    10. Beca de viaje en RIAO/OPTILAS 2010, Society of Photo-Optical Instrumentation Engineering, 2010.
       

    Patentes

    1. C. Trujillo, J. F. Restrepo, y J. García-Sucerquia, "MICROSCOPIO, HOLOGRÁFICO SIN LENTES (MHDSL) Y MÉTODO PARA VISUALIZAR MUESTRAS," Patente U.S. 7620179 (2018).
       

    Software Licenciado

    1. Digital Lensless Holographic Microscopy.
    2. JDiffraction.

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    Correo

    catrujilla@eafit.edu.co​​ ​

    Dirección

    Carrera 49 N 7 sur 50, Medellín-Colombia. Bl 19.

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